Infecções virais no sistema nervoso central em pacientes submetidos à internação hospitalar: investigação baseada em uma plataforma de “mini-arranjo” de PCR em tempo real singleplex
| dc.contributor.advisor | Thomasini, Ronaldo Luis | |
| dc.contributor.advisorco | Melo, Gustavo Eustáquio Brito Alvim de | |
| dc.contributor.author | Silva, Thyago José | |
| dc.contributor.institution | Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM) | pt_BR |
| dc.contributor.referee | Thomasini, Ronaldo Luis | |
| dc.contributor.referee | Costa, Sandra Cecília Botelho | |
| dc.contributor.referee | Martins, Helen Rodrigues | |
| dc.date.accessioned | 2022-02-23T19:29:03Z | |
| dc.date.available | 2022-02-23T19:29:03Z | |
| dc.date.issued | 2021 | |
| dc.date.submitted | 2021-09-08 | |
| dc.description.abstract | As infecções no Sistema Nervoso Central (SNC) apresentam distribuição global e são importantes causas de morbidade e mortalidade. Estas infecções podem ser causadas principalmente por bactérias, fungos e vírus, sendo as infecções virais as mais frequentes. As etiologias das infecções virais no SNC mais frequentes são os enterovírus, herpesvirus, adenovírus e os arbovírus. No Brasil, entretanto, na maioria dos casos, o agente causador não é identificado. Métodos baseados em biologia molecular estão sendo cada vez mais aplicados no diagnóstico de doenças infeciosas. Assim, este estudo visou a aplicação de uma plataforma de “mini-arranjo” de Reação em Cadeia da Polimerase em tempo real (qPCR) para a identificação de agentes virais causadores de infecções no SNC. Para tal, amostras de líquor de pacientes com suspeita de infecção viral internados no hospital Santa Casa de Caridade de Diamantina/MG no período de janeiro de 2019 a julho de 2021 foram coletadas e analisadas pela plataforma. Foram testadas 73 amostras, sendo que em 39 foram identificados material genético de vírus. Houve maior número de casos de Zika vírus (ZIKV) 27/73 (36,99%), seguido por Citomegalovírus (CMV) 5/73 (6,85%), Epstein-Barr vírus (EBV) 4/73 (5,48%), Herpesvirus Humano-6 (HHV-6) 4/73 (5,48%), Adenovírus (ADV) 4/73 (5,48%) e Enterovírus (ENTV) 4/73 (5,48%), Herpesvirus Humano-7 (HHV-7) 3/73 (4,11%), Herpes simples vírus 1/2 (HSV-1/2) e John Cunninghan vírus (JCV) 2/73 (2,74%). O Varicela-Zóster vírus (VZV), o Dengue vírus (DENV), o Chikungunya vírus (CHIKV) e também o Coronavírus da Síndrome Respiratória Aguda Grave 2 (SARS-CoV-2) não foram detectados em nenhuma das amostras analisadas. Foram detectados 9 casos de coinfecção entre o ZIKV, ADV, ENTV e os vírus da família Herpesviridae e 4 casos de coinfecção entre vírus e outros patógenos não virais. Nossos achados evidenciam a circulação de Zika vírus durante o período de coleta das amostras, além de reforçar a importância de se considerar este agente como causador de infecções no sistema nervoso central. A plataforma desenvolvida mostrou que pode ser útil para o diagnóstico de infecções virais no SNC e de utilidade para aplicação na rotina clínica laboratorial. Os resultados de testes moleculares precisam ser interpretados com cautela, especialmente, os que apresentam baixa carga viral. Sugere-se que determinação de carga viral com valores de corte definidos possam ser mais elucidativos que testes qualitativos. | pt_BR |
| dc.description.abstracts | Central Nervous System (CNS) infections are globally distributed and they are important causes of morbidity and mortality. These infections can be caused mainly by bacteria, fungi, or viruses, which the viral infections are the most frequent. The most frequent etiologic agents of viral infections in the CNS are enteroviruses, herpesviruses, adenoviruses, and arboviruses. In Brazil, however, in most cases, the causative agent is not identified. Methods based on molecular biology are turning most usual in the diagnosis of infectious diseases. Thus, this study aimed to apply a real-time Polymerase Chain Reaction (qPCR) platform based on a “mini-array” conformation for the identification of viral agents that cause CNS infections. For this purpose, CSF samples from patients with suspected viral infection hospitalized at the Santa Casa de Caridade Hospital in Diamantina/MG from January 2019 to July 2021 were collected and analyzed by the platform mentioned above. A total of 73 samples were tested, and in 39 samples, viral DNA\RNA was identified. Zika virus (ZIKV) was most frequently detected (27/73) (36.99%), followed by Cytomegalovirus (CMV) 5/73 (6.85%), Epstein-Barr virus (EBV) 4/73 (5, 48%), Human Herpesvirus-6 (HHV-6) 4/73 (5.48%), Adenovirus (ADV) 4/73 (5.48%) and Enterovirus (ENTV) 4/73 (5.48%), Human Herpesvirus-7 (HHV-7) 3/73 (4.11%), Herpes simplex virus 1/2 (HSV-1/2) and John Cunninghan virus (JCV) 2/73 (2.74%). Varicella- Zoster virus (VZV), Dengue virus (DENV), Chikungunya virus (CHIKV), and also Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) were not detected in any of the analyzed samples. Nine cases of coinfection between ZIKV, ADV, ENTV, and Herpesviridae family viruses and 4 cases of coinfection between virus and other non-viral pathogens were found. Our findings showed the circulation of Zika virus during the sample collection period and it remarks the importance to consider this agent as a cause of infections in the central nervous system. The platform developed showed that it can be useful for the diagnosis of viral infections in the CNS and useful for application in clinical laboratory routines. The results of molecular tests must be carefully interpreted, especially those with a low viral load. It is suggested that viral load measurement using defined cutoff values can be more informative than qualitative tests. | en |
| dc.description.thesis | Dissertação (Mestrado) – Programa de Pós-graduação em Ciências Farmacêuticas, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2021. | pt_BR |
| dc.identifier.citation | SILVA, Thyago José. Infecções virais no sistema nervoso central em pacientes submetidos à internação hospitalar: investigação baseada em uma plataforma de “mini-arranjo” de PCR em tempo real singleplex. 2021. 100 p. Dissertação (Mestrado em Ciências Farmacêuticas) – Programa de Pós-graduação em Ciências Farmacêuticas, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, Diamantina, 2021. | pt_BR |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.ufvjm.edu.br/items/5d8460a1-ed4b-4fc3-9164-18408c85297e | |
| dc.language.iso | por | |
| dc.publisher | UFVJM | pt_BR |
| dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
| dc.rights.license | A concessão da licença deste item refere-se ao à termo de autorização impresso assinado pelo autor, assim como na licença Creative Commons, com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri e o IBICT a disponibilizar por meio de seus repositórios, sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, e preservação, a partir desta data. | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Vírus | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Sistema Nervoso Central | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Mini-arranjo | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real | pt_BR |
| dc.subject.keyword | Viruses | en |
| dc.subject.keyword | Central Nervous System | en |
| dc.subject.keyword | Mini-array | en |
| dc.subject.keyword | Real-Time Polymerase Chain Reaction | en |
| dc.title | Infecções virais no sistema nervoso central em pacientes submetidos à internação hospitalar: investigação baseada em uma plataforma de “mini-arranjo” de PCR em tempo real singleplex | pt_BR |
| dc.type | Dissertação | pt_BR |