Avaliação genética da prenhez precoce em animais da raça Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos

dc.contributor.advisorPereira, Idalmo Garcia
dc.contributor.authorGarcia, Diogo Anastácio
dc.contributor.institutionUniversidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)pt_BR
dc.contributor.refereePereira, Idalmo Garcia
dc.contributor.refereePires, Aldrin Vieira
dc.contributor.refereeSilva, Fabyano Fonseca e
dc.date.accessioned2015-11-16T13:55:28Z
dc.date.available2015-11-16T13:55:28Z
dc.date.issued2010
dc.date.submitted2010-02-22
dc.descriptionÁrea de concentração: Produção Animal.pt_BR
dc.description.abstractObjetivou-se avaliar a aplicação dos modelos lineares generalizados mistos na avaliação genética da prenhez precoce, comparando as funções de ligação probit e logit, utilizando dados simulados e reais, além de avaliar os efeitos na variabilidade genética e na seleção de reprodutores quando diferentes definições desta característica são adotadas. O processo de simulação foi determinado pela transformação aplicada para se obterem as probabilidades de prenhez das novilhas e da função de ligação utilizada na análise dos dados, sendo construídas as estruturas de simulação: logit-logit (LL), logit-probit (LP), probit-logit (PL) e probit-probit (PP). Foram adotadas distintas porcentagens de fêmeas precoces (%FP): 5, 10, 15, 20, 25 e 30%. Para cada cenário de simulação, construídos pela combinação das estruturas e %FP, foram realizadas 100 repetições, sendo o valor paramétrico da herdabilidade (h2) igual a 0,40. Nos dados reais, a prenhez precoce foi definida aos 15, 17, 19 e 21 meses, representadas por PP15, PP17, PP19 e PP21. A implementação da simulação e a estimação dos parâmetros e predição dos valores genéticos foram realizadas no software R. No estudo de simulação, as estimativas obtidas para a herdabilidade ( ) foram comparadas com o valor paramétrico por meio do Erro Quadrático Médio (EQM). Correlações de Pearson (CP), entre os valores genéticos preditos e reais, e a porcentagem de touros em comum, entre a classificação real e predita, considerando apenas 10% dos touros com maiores valores genéticos (TOP10) foram calculadas. Para os dados reais, correlações de Pearson, entre os valores genéticos preditos pelas funções de ligação, e a TOP10, entre a classificação predita pela logit e probit e em cada função entre PP15, PP17, PP19 e PP21 foram mensuradas. Além disso, para comparar o ajuste dos modelos, foram calculados os critérios de informação Bayesiano de Schwarz (BIC) e de Akaike (AIC). Considerando a simulação, as estruturas LP e PL apresentaram resultados inferiores a LL e PP. Os valores de , EQM, correlações de Pearson e TOP10, para as estruturas LL e PP, foram muito próximos. Para os dados reais, as para PP15, PP17, PP19 e PP21, foram próximas entre logit e probit, com exceção da PP15. As CP e a TOP10 entre as funções foram altas. O AIC e BIC apresentaram-se semelhantes entre as funções, independente da classe de prenhez estudada. A TOP10, considerando a predição da mesma função de ligação, entre PP17-PP19, PP17-PP21 e PP19-PP21 foram de moderadas a alta. Entretanto, a TOP10 entre PP15-PP17, PP15-PP19 e PP15-PP21 podem ser consideradas baixas, independente da função utilizada. É necessário comparar o ajuste das funções de ligação, uma vez que ao simular dados na escala logit e alisá-los por probit, e vice-versa, os resultados nas estimativas dos parâmetros e predição não foram satisfatórios como aqueles apresentados quando se gerou e analisou os dados por meio da mesma escala e função de ligação. Para as classes de precocidade estudadas, os modelos apresentaram estimativas de parâmetros genéticos, predições dos efeitos aleatórios e ajuste dos modelos muito semelhantes. A classificação dos touros foi consideravelmente diferente entre PP15-PP17, PP15-PP19 e PP15-PP21.pt_BR
dc.description.abstractsABSTRACT This study aimed to evaluate the application of generalized linear mixed models on genetic evaluation of early pregnancy, by comparing probit and logit functions and using simulated and real data. Besides this, effects on genetic variability and on selection of sires under different definition are adopted. Simulation process was determined by the transformation applied to obtain probabilities of heifer pregnancy and the function used to analyze data, being simulation structures: logit-logit (LL), logit-probit (LP), probit-logit (PL) and probit-probit (PP). Different percentages of early female (%EF) were adopted: 5, 10, 15, 20, 25 and 30%. To each simulation, formed according to structures and %EP combination, there were 100 repetitions, being 0.40 the parametric value of heritability (h2). At real data, early pregnancy was determined at 15, 17, 19 and 21 months, represented by EP15, EP17, EP19 and EP21. To implement simulation, estimate parameters and predict genetic values, software R was used. In simulation study, estimative obtained to heritability ( ) were compared to parametric value through mean-square error (MSE). Pearson correlations (PC) were calculated between genetic real or predicted values and percentage of bulls in common, between real and predicted classification, considering only 10% of bulls with higher genetic values (TOP 10). To real data, there was Pearson Correlation between genetic values predicted by functions and the TOP10, between classification predicted by logit and probit and in each function between EP15, EP17, EP19 and EP21. In order to compare models adjustment, information criteria of Bayesiano of Schwarz (BIC) and Akaike (AIC) were calculated. Considering the simulation, LP and PL structures showed results inferior to LL and PP. Values of , MSEEQM, Pearson correlation and TOP10, to as LL and PP, were near. To real data, to EP15, EP17, EP19 and EP21, were near between logit and probit, except to EP15. AIC and BIC were similar among functions, independently of pregnancy class studied. Considering prediction of same function between EP17-EP19, EP17-EP21 and EP19-EP21 was from moderated to high. However, TOP10 between EP15-EP17, EP15-EP19 and EP15-EP21 can be considered low in any function. It is necessary to compare function adjustment because when data is simulated in logit and analyzed by probit, and vice-versa, results on estimated and predicted parameters were not satisfactory as the one shown when data were created and analyzed by the same scale and function. In precocity classes studied, the models showed estimative of genetic parameters, random effect prediction and models adjustment very similar. Bulls’ classification was very different EP15-EP17, EP15-EP19 and EP15-EP21.en
dc.description.sponsorshipFundação de Amparo à Pesquisa do estado de Minas Gerais (FAPEMIG)pt_BR
dc.description.thesisDissertação (Mestrado) – Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2010.pt_BR
dc.identifier.citationGARCIA, Diogo Anastácio. Avaliação genética da prenhez precoce em animais da raça Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos. 2010. 50 p. Dissertação (Mestrado) – Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, Diamantina, 2010.pt_BR
dc.identifier.urihttp://acervo.ufvjm.edu.br:8080/jspui/handle/1/730
dc.language.isoporpt_BR
dc.publisherUFVJMpt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.rights.licenseA concessão da licença deste item refere-se ao à termo de autorização impresso assinado pelo autor, assim como na licença Creative Commons, com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri e o IBICT a disponibilizar por meio de seus repositórios, sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, e preservação, a partir desta data.pt_BR
dc.subject.keywordGado de cortept_BR
dc.subject.keywordHerdabilidadept_BR
dc.subject.keywordGLMMpt_BR
dc.subject.keywordNelorept_BR
dc.subject.keywordSimulaçãopt_BR
dc.titleAvaliação genética da prenhez precoce em animais da raça Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistospt_BR
dc.title.alternativeGenetic evaluation of early pregnancy in Nellore cattle by using generalized linear mixed modelsen
dc.typeDissertaçãopt_BR

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